（1）機器の選択。医薬品機器の選択においては、経験に基づく選択（実際の計算を行わない、あるいはデータ計算が不十分）、盲目的な進歩の追求、物理的データの調査不足など、機器の実用性や経済性に重大な影響を与える問題がいくつかある。

（2）設備の設置とトレーニング。医薬品設備の設置プロセスでは、工事の進捗状況に重点が置かれ、施工品質が軽視されることが多く、後期における設備メンテナンスコストの増加につながります。さらに、設備メンテナンス担当者や操作担当者へのトレーニングが不十分であることも、医薬品設備の管理・メンテナンスにリスクをもたらします。

（3）情報化管理・保守への投資不足。現在、多くの企業が設備管理・保守を重視し、設備保守記録の管理や基本パラメータの記録などを実施しているものの、継続的な保守データの提供が困難であること、仕様書や図面などの有効な製薬設備仕様情報が不足していることなど、依然としていくつかの問題が残っており、こうした目に見えない情報が設備管理、保守、改修の難易度を高めています。

（4）管理システム。効果的な管理システムと方法が欠如しているため、医薬品機器の保守担当者の管理が不十分で、保守担当者の作業が標準化されておらず、医薬品機器の管理と保守プロセスに安全上の潜在的な危険性が残されている。